L’histoire officielle de l’Université de Jérusalem commence en 1882. Cette année-là, le Professeur Herman Zvi Shapira propose la création d’une université pour le peuple juif. Cinq ans plus tard, le 11ème Congrès sioniste, qui se tient à Vienne, vote une motion en faveur de l’établissement de l’Université Hébraïque de Jérusalem. En 1918, la construction de l’édifice début sur le Mont Scopus en présence de Chaïm Weizmann, du Général Allenbyet de dirigeants juifs.
Le premier conseil d’administration de l’université est composé de : Chaïm Weizmann,Albert Einstein, Sigmund Freud, Martin Buber, Chaim Nachman Bialik, Cyrus Adler,Yehuda Magnes, Ahad Ha’am et du rabbin Avraham Kook. Leur projet était faire de l’Université Hébraïque de Jérusalem, “une institution universitaire respectée sur le plan international qui ferait office de principal établissement d’enseignement donnant au peuple juif les ressources culturelles, spirituelles et intellectuelles de leur patrimoine et favorisant la formation de nouvelles générations de scientifiques, philosophes, hommes d’état, professeurs, agronomes et entrepreneurs commerciaux pour les besoins croissants d’une nouvelle nation”.
En 1923, Albert Einstein donne une conférence scientifique d’inauguration. Il édite également, au cours de ce voyage qui restera son unique en Terre sainte, la première publication scientifique de l’université. Cette même année, l’Institut de chimie de l’Université est créé.
Le 1er avril 1925, l’Université Hébraïque de Jérusalem est inauguré sur le Mont Scopus par Lord Balfour. Dix ans plus tard, en 1935, l’UHJ émet les premiers certificats permettant aux jeunes juifs réfugiés européens d’entrer dans le pays et d’étudier. La même année, la Faculté des Sciences voit le jour. Chaïm Weizmann est désigné Doyen. L’année suivant, en 1936, le Premier doctorat est décerné.
Le 13 avril 1948, quelques jours avant la déclaration d’indépendance, 77 membres de la faculté et du personnel de l’université et de l’hôpital Hadassah sont tués lors de l’attaque d’un convoi terroriste. En août de la même année, le gouvernement provisoire israélien reconnaît l’importance de l’Université de Jérusalem “comme une institution scientifique centrale de l’Etat d’Israël” et son devoir “de poursuivre ses activités et de les développer.” Le campus du Mont Scopus est isolé de l’ouest de Jérusalem.
En 1949 : L’université déménage dans des locaux de fortune éparpillés aux quatre coins de Jérusalem. L’Ecole de médecine Hadassah de l’Université Hébraïque, la Faculté de droit et le Centre d’Education pour adultes sont inaugurés. Le premier institut d’été pour étudiants étrangers a lieu.
En 1955, l’UHJ crée le premier programme d’un an, destiné aux étudiants étrangers. Trois ans plus tard, le Campus de Givat Ram est inauguré. En 1960, c’est au tour du Campus médical d’Ein Kerem. En 1964, veille du 40e anniversaire de l’UHJ : La Société de développement de la recherche Yissum est créée pour breveter les résultats des recherches de l’Université et promouvoir les partenariats de l’Université avec l’industrie.
1967 : La réunification de Jérusalem rétablit l’accès au Mont Scopus. La rénovation du campus Scopus commence. Une fois Jérusalem unifiée, l’accès au Mont Scopus est rétabli. La rénovation du campus du Mont Scopus commence. Deux ans plus tard, l’activité reprend dans cette portion de l’université.
En 1975, est inauguré l’Institut pour les études avancées. Une décennie plus tard, en 1985, l’École de médecine vétérinaire “Korest” ouvre ses portes. En 1998, l’École internationale Rothberg (ancienne l’école pour les étudiants étrangers) déménage dans le bâtiment Boyar.
Un an plus tard, en 1999, est inaugurée l’Ecole des sciences de la technologie et de l’informatique “Selim et Rachel Benin”. En 2003, le campus Edmond J. Safra à Givat Ram est inauguré. En 2005, les cinq centres informatiques Ginges sont achevés.

